Tiukka taloudenpito ja henkilöstön osallistuminen kehittämishankkeisiin pitivät Etelä-Karjalan liiton talouden kurissa.
Vuoden 2019 vuosikate, tilikauden tulos ja tilikauden ylijäämä kohenivat edellisestä vuodesta. Etelä-Karjalan liiton tilinpäätös ylsi 37 000 euroa plussalle.
Osa toiminnallisista tavoitteista jäi kuitenkin toteutumatta maakuntauudistuksen kaatumisen takia.
Etelä-Karjalan liiton toimintakulut ovat noin viisi miljoonaa euroa.
Tulonsa maakuntaliitto kerää jäsenkunniltaan sekä erilaisista EU:n rahoitusohjelmista ja projektirahoituksista.
Jäsenkuntien maksuosuuksien yhteismäärä on pysynyt ennallaan vuodesta 2016.