Metsä ja ympäristö
Bioenergian tuottaminen puhtaasti, terveellisesti ja kestävästi (Sustainable Bioenergy, Climate Change and Health), professori Jorma Jokiniemi
Ilmastonmuutos ja metsiin liittyvät vuorovaikutukset (Changing Climate and Biological Interactions Related to Forests, CABI), professori Riitta Julkunen-Tiitto
Metsäekosysteemien uudet kaukokartoituspohjaiset seurantajärjestelmät (Multi-scale Geospatial Analysis of Forest Ecosystems), professori Matti Maltamo
Pienhiukkasten vaikutus ilmastoon: epävarmuuksien mallinnus ja minimointi (Aerosols and Climate: Reduction of Uncertainty of the Models), professori Ari Laaksonen
Terveys ja hyvinvointi
Itä-Suomen yliopiston syöpäkeskus – perustutkimuksesta klinikkaan (Cancer Center of Eastern Finland: Molecular Mechanisms of Cancer), professori Veli-Matti Kosma
Neurodegeneratiivisten aivosairauksien tautimekanismit, biomarkkerit ja uudet hoitostrategiat (Translational Identification of Biomarkers and Therapeutic Strategies for Neurodegenerative Diseases, UEF-BRAIN), professori Asla Pitkänen
Tyypin 2 diabeteksen ja insuliiniresistenssin genetiikka ja nutrigenomiikka (Systems Genetics and Nutrigenomics of Type 2 Diabetes and Insulin Resistance Related Traits, GENENUTRI), professori Markku Laakso
Uusien endovaskulaaristen hoitojen kehittäminen (Novel Endovascular Therapies in Post-genomic Area), professori Seppo Ylä-Herttuala
Uudet teknologiat ja materiaalit
Fosfori- ja/tai typpiyhdisteisiin perustuvat uudet materiaalit, teknologiat ja lääkeainemolekyylit (Novel Materials, Technologies and Drug Molecules Based on Phosphorus and/or Nitrogen Compounds), professori Jouko Vepsäläinen
Räätälöidyt materiaalit uusiin teknologioihin (Tailored Materials for New Technologies), professori Jari Turunen
Tuki- ja liikuntaelinsairauksien poikkitieteellinen tutkimus – kohti parempaa diagnostiikkaa ja hoitoa (Interdisciplinary, Translational Research for Improved Diagnosis and Treatment of Musculoskeletal Diseases - Musculoskeletal Research Consortium, MSRC), professori Jukka Jurvelin
Uudentyyppisten nanorakenteisten materiaalien farmaseuttiset, biolääketieteelliset ja ympäristösovellukset (Novel Nanostructured Materials for Pharmaceutical, Biomedical and Environmental Applications, NAMBER), professori Vesa-Pekka Lehto
Uudet molekyylilääketieteen kantasoluteknologiat (Novel Stem Cell Technologies and Materials for Translational Research in Molecular Medicine, UEF-STEM), professori Jari Koistinaho