Tutkimuksessa selvisi, että polttoaineiden raakamateriaalina käytetyistä kasveista puolet tulee viljelyksiltä, jotka on raivattu aiemmin koskemattomina pysyneiden sademetsien tilalle. Tutkijat arvioivat, että ainakin kolmasosa viimeaikaisista sademetsien tuhoista voi johtua biopolttoaineiden kysynnän kasvusta.
Tutkijoiden mukaan onkin mahdollista, että uusien viljelysten perustaminen aiheuttaa enemmän hiilidioksidipäästöjä kuin mitä niillä tuotetuilla biopolttoaineilla säästetään.
Esimerkiksi hyvätuottoisen sokeriruo'on käyttäminen polttoaineena olisi päästöjen kannalta hyödyllistä vasta 40 - 120 vuodessa.
Biopolttoaineita on pidetty ympäristöystävällisenä vaihtoehtona fossiilisille polttoaineille. Viime aikoina niiden hyödyt on kuitenkin kyseenalaistettu muun muassa siksi, että viljelykasvien käyttäminen polttoaineeksi nostaa ruoan hintaa.
Viime vuosina biopolttoaineiden tuotanto on kasvanut räjähdysmäisesti. Esimerkiksi maailmanlaajuinen etanolin tuotanto kasvoi nelinkertaiseksi vuosina 2000 - 2007. Samassa ajassa biodieselin tuotanto kasvoi peräti kymmenkertaiseksi.