Asianajajat eivät tiedä, mihin Hodorkovski on siirretty. Oikeuslähteen mukaan Hodorkovskin sukulaisille ilmoitetaan kymmenen päivän kuluessa, mille vankileirille hänet on siirretty.
Hodorkovskia pidettiin vankilassa Moskovassa toisen oikeudenkäyntinsä aikana. Hänet siirrettiin Moskovaan Siperian Tshitan vankileiriltä helmikuussa 2009.
Hän sai toisessa oikeudenkäynnissä tuomion rahanpesusta ja kavalluksesta.
Hodorkovski on ollut vankilassa vuodesta 2003. Hodorkovskin ensimmäinen tuomio rahanpesusta ja kavalluksesta päättyy syksyllä. Toinen tuomio pitää hänet vankilassa vielä 13 vuotta.